马里奥和碧奇公主来到游乐园排队乘坐“天驱炮”，结果在发射中途被改变了方向，桃子公主被发射到库巴城堡中。马里奥的弹珠大冒险由此展开。在本作中，马里奥将化身为弹珠通过一个个弹珠台形状的冒险舞台。游戏规则与普通弹珠台游戏相同，只要不掉到挡板之间就不会GameOver。要进入库巴城中解救碧奇公主就要获得4把星之键，星之键就散落在各个关卡中。马里奥乘坐天驱炮变成球后就可以选择目的地，每个关卡分为多个区域，将各个区域中的机关接触后就会获得星星，得到一定数量的星星后就可以进入下一个区域了。